佛教认为佛菩萨或高僧大德圆寂后，可得舍利。《玄应音义》载：“舍利有全身、碎身之别”。全身舍利即是指高僧示寂后，其身体经久不烂，常保原形而栩栩如生者。碎身舍利指高僧大德荼毗后之遗骨。我们所说的肉身菩萨，就是佛教所说的全身舍利。《金梵明经》载：“舍利者，是戒定慧之所熏修，甚难可得，最上福田”。戒定慧之所熏修，就是佛教对肉身不烂的解释。

纵观现存的肉身菩萨，其生前无一不修持严谨。他们虽表现各异，有的深山苦修;有的入世行医;有的疯傻颠倒相;有的治身心于一处，一站就是三年。虽然他们修行的方式不一样，但都应机说法，利乐众生，外现凡行，内存清净。由于他们严谨的修持，使他们的心体广大，内心清净。心无污染，行为自然高尚，他们的身体机能也随之发生了变化，潜能显现，灵异显现，有的能示现神通。这种身心的变化，是无比复杂而神奇的，戒定慧之所熏修，是佛教对肉身菩萨现象的基本解释。严谨的修持，是肉身不烂的主要原因。

在教内，修持严谨的高僧大德非常多，但肉身菩萨为什么这样少呢?这与修行者的愿心有直接的关系。许多高僧在圆寂时。嘱咐将遗体火化。我曾问过一位公认的高僧，问他往坐后是否保留遗体，他说：“四大皆空，不着于相，留个臭皮囊干什么?”这是大多数修行者的观点。

至于这些肉身菩萨，他们在圆寂前嘱咐保留遗体，完全是慈悲度生的愿心。八万四千法门度八万四千种众生，这些肉身菩萨在上求佛道，下化众生的共愿之中，又发下别愿，留此肉身，以身弘法，以身说教，以身度尘，这是接引众生的一种方便。因为有些人，在看到木雕泥塑的佛菩萨时，不能产生恭敬心，认为那是假的，但在看到肉身菩萨时，觉得可亲可近，内心震撼，认为那是真的，愿意供养皈依。所以有些高僧在圆寂之前，发愿要留下肉身，顺应众生，正因为如此，从古到今。肉身菩萨不断出现。